Apare ca urmare a stimulării insuficiente a funcției ovariene de către hormonii gonadotropi (GH) ai glandei pituitare. Se poate observa o secreție redusă sau inadecvată de GH de către glanda pituitară cu afectarea gonadotrofelor acesteia sau cu stimularea scăzută a gonadotrofelor de către hormonul luteinizant al hipotalamusului, adică hipofuncția ovariană secundară poate fi de geneză hipofizară, hipotalamică și, mai des, mixtă - hipotalamo-hipofizară.