H. influenzae sunt celule gram-negative pleomorfe, în formă de bastonaș sau cocoide, cu dimensiunile de (0,2-0,3) x (0,5-2) µm. Se localizează în frotiuri individual sau în perechi, uneori sub formă de lanțuri scurte și grupuri. Pe medii dense formează colonii mici (până la 1 mm în diametru), rotunde și incolore. Microorganismele sunt imobile, nu formează spori, dar este posibilă formarea de forme capsulare, cu care sunt asociate proprietăți patogene. Agentul patogen produce endotoxină, al cărei purtător este considerat a fi polizaharidele capsulare.