Meningococii sunt celule sferice gram-negative cu un diametru de 0,6-0,8 µm. În frotiurile preparate din material prelevat de la un pacient, acestea au forma unei boabe de cafea, sunt adesea localizate în perechi sau tetrade sau aleatoriu, adesea în interiorul leucocitelor - fagocitoză incompletă.