Genomul VHC este reprezentat de un ARN monocatenar încărcat pozitiv, care codifică 3 proteine structurale (nucleocapsida proteică centrală și nucleoproteinele anvelopei E1-E2) și 5 proteine structurale (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5). Pentru fiecare dintre aceste proteine sunt sintetizate antitransferaze (AT), care se găsesc în sângele pacienților cu hepatită virală C.