Determinarea anticorpilor împotriva fracției microsomale a glandei tiroide este utilizată pentru diagnosticarea tiroiditei autoimune și a hipotiroidismului, în care nivelul anticorpilor din sânge crește. Anticorpii împotriva microzomilor tiroidieni formează complexe imune pe suprafața celulelor, activează complementul și limfocitele citotoxice, ceea ce duce la distrugerea celulară și la formarea unui proces inflamator în glanda tiroidă.